RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 MOCS1Q9NZB8 636 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SLC17A6Q9P2U8 582 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 OBSL1O75147 1896 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 A0A1W2PRU2 124 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CKMP06732 381 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GNA12Q03113 381 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 IL10RBQ08334 325 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GDAP1Q8TB36 358 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SPON2Q9BUD6 331 aa25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 FAM47DPA6NHR8 397 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MYL4P12829 197 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TMC8Q8IU68 726 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 LZTS1Q9Y250 596 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CCDC78A2IDD5 438 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GMNCA6NCL1 334 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 H3BNC9 293 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 NDUFAB1O14561 156 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGEF15O94989 841 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MT-ND3P03897 115 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 NPY2RP49146 381 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CHRAC1Q9NRG0 131 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 IRAK3Q9Y616 596 aa25.05■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CLDN11O75508 207 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ALDH1A2O94788 518 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CD86P42081 329 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 DSC2Q02487 901 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 FATE1Q969F0 183 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MFSD3Q96ES6 412 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 LRRC3Q9BY71 257 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 IL22Q9GZX6 179 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.04■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PRAMEF11O60813 436 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 OLFM2O95897 454 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 RHOCP08134 193 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ERVK-10P10266 1014 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CA4P22748 312 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 BMPR2Q13873 1038 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SPANXN3Q5MJ09 141 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CDKL2Q92772 493 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TTC17Q96AE7 1141 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MAGEH1Q9H213 219 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 A0A1B0GVM2 712 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ANKRD65E5RJM6 399 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 EBAG9O00559 213 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 IRS1P35568 1242 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 RASSF3Q86WH2 238 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PGBD5Q8N414 524 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 BHMTQ93088 406 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SERAC1Q96JX3 654 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GCNAQ96QF7 691 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CCT8L2Q96SF2 557 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ASAH2Q9NR71 780 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF180Q9UJW8 692 aa25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 AP3B1O00203 1094 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 LPXNO60711 386 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 KRT37O76014 449 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 GLDCP23378 1020 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CHRNA4P43681 627 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CLCN4P51793 760 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 WNT3AP56704 352 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF235Q14590 738 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 POU6F1Q14863 301 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 TEX26Q8N6G2 289 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 CERS2Q96G23 380 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 MYO7AQ13402 2215 aa25.02■■□□□ 1.6
CNNM2-201ENST00000369875 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CNNM2-201ENST00000369875 TBL1XO60907 577 aa25.01■■□□□ 1.59
CNNM2-201ENST00000369875 RFPL2O75678 378 aa25.01■■□□□ 1.59
CNNM2-201ENST00000369875 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CNNM2-201ENST00000369875 MPP3Q13368 585 aa25.01■■□□□ 1.59
CNNM2-201ENST00000369875 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms