RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPM1 405 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MUSKO15146 869 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ATP9BO43861 1147 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RHOCP08134 193 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MSH2P43246 934 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DSC2Q02487 901 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 HTR3DQ70Z44 454 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TDRPQ86YL5 185 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GCNAQ96QF7 691 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FICDQ9BVA6 458 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEH1Q9H213 219 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MYLKQ15746 1914 aa15.62■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GVM2 712 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GFRA2O00451 464 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MMP2P08253 660 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CD86P42081 329 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 IFNAR2P48551 515 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 EPHA5P54756 1037 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PCSK7Q16549 785 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CHST9Q7L1S5 443 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PPM1NQ8N819 430 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 FATE1Q969F0 183 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD8Q96I13 439 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DHRS4Q9BTZ2 278 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ILVBLA1L0T0 632 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC78A2IDD5 438 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 EPOPA6NHQ4 379 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 H0Y626 953 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 RFXAPO00287 272 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KDELR3O43731 214 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA9O76027 345 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ADRA1AP35348 466 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MPP2Q14168 576 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 BFARQ9NZS9 450 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD3O43242 534 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SNAP91O60641 907 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SPAG6O75602 509 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 LATS1O95835 1130 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 C1RP00736 705 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 PRKCHP24723 683 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 CHRNA4P43681 627 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GEMP55040 296 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 OXCT1P55809 520 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 WNT3AP56704 352 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 GNGT1P63211 74 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 STEAP4Q687X5 459 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 KDELC1Q6UW63 502 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 DDI1Q8WTU0 396 aa15.6■□□□□ 0.09
CASQ1-201ENST00000368078 ING5Q8WYH8 240 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms