RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366782.5

PSEN2-201, Transcript of presenilin 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSEN2, Length 2,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2-201ENST00000366782 CLCNKBP51801 687 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 AIF1P55008 147 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 AQP4P55087 323 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 BEX3Q00994 111 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZNF460Q14592 562 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GBP5Q96PP8 586 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 IL22Q9GZX6 179 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 WDCPQ9H6R7 721 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PDP2Q9P2J9 529 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.7□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 UNCXA6NJT0 531 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GRID2O43424 1007 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TIMM44O43615 452 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FBXO21O94952 628 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 AHSGP02765 367 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 RAG1P15918 1043 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GRIA4P48058 902 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 KBTBD6Q86V97 674 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GPR22Q99680 433 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 RTKNQ9BST9 563 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TASP1Q9H6P5 420 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 RAD54BQ9Y620 910 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MYLKQ15746 1914 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 HAS3O00219 553 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 AIM2O14862 343 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PRDX6P30041 224 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CXCR3P49682 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PSEN2P49810 448 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TMEM198Q66K66 360 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TLK2Q86UE8 772 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 LSMEM2Q8N112 164 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 KIFC1Q9BW19 673 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DRC3Q9H069 523 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.69□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MAGEB16A2A368 324 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TARM1B6A8C7 271 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PIGNO95427 931 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PIK3R1P27986 724 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 NAGLUP54802 743 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MPP1Q00013 466 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DLG1Q12959 904 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ANO4Q32M45 955 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FSCBQ5H9T9 825 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TAC4Q86UU9 113 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CEP97Q8IW35 865 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 LPPQ93052 612 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 GAD1Q99259 594 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 NDNQ99608 321 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 NUF2Q9BZD4 464 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 NEU3Q9UQ49 428 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 TFEBP19484 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CDH17Q12864 832 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 CTBP1Q13363 440 aa14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PSEN2-201ENST00000366782 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms