RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GPAMQ9HCL2 828 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SIX2Q9NPC8 291 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SCML2Q9UQR0 700 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KNTC1P50748 2209 aa7.17□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC01553A4QN01 128 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ANP32DO95626 131 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 STMN1P16949 149 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CSKP41240 450 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ELK3P41970 407 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 POU4F1Q01851 419 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAP7Q14244 749 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HGSNATQ68CP4 663 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXL22Q6P050 247 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SMARCD2Q92925 531 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HLA-CQ95604 372 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMG2Q969U7 264 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 E2F7Q96AV8 911 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HMCESQ96FZ2 354 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FIZ1Q96SL8 496 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGEH1Q9H213 219 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MFSD11O43934 449 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SUN1O94901 812 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GUCA1CO95843 209 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CHRNB2P17787 502 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SEMG2Q02383 582 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 INCA1Q0VD86 236 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DPYSL3Q14195 570 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PIGVQ9NUD9 493 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 RNF112Q9ULX5 631 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HIDE1A8MVS5 230 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CFLARO15519 480 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 OAZ2O95190 189 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ERVK-10P10266 1014 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXB2P14652 356 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCG1P45844 678 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DSG1Q02413 1049 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PTK2BQ14289 1009 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM110Q86TL2 294 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ALG3Q92685 438 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 MYO19Q96H55 970 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM247A6NEH6 219 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 ZW10O43264 779 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 COCHO43405 550 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 TIMM44O43615 452 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 SUPT7LO94864 414 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PRLRP16471 622 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 PSMC3P17980 439 aa7.15□□□□□ -1.26
LRRTM3-201ENST00000361320 FMO4P31512 558 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms