RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 F2P00734 622 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 F9P00740 461 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 AMHP03971 560 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 EPHA3P29320 983 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 GJA5P36382 358 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 CHN2P52757 468 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SLC12A1Q13621 1099 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 ITGA7Q13683 1181 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 UGP2Q16851 508 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 STYXQ8WUJ0 223 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 GRID2O43424 1007 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 AP1G1O43747 822 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SBK3P0C264 359 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 TPH1P17752 444 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 TMC7Q7Z402 723 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 FAM35AQ86V20 835 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 SCYL1Q96KG9 808 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 APBA2Q99767 749 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 TXNDC9O14530 226 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 AP1G2O75843 785 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 TFEBP19484 476 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 RAB27AP51159 221 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF33AQ06730 810 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 FLOT2Q14254 428 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 PIGGQ5H8A4 983 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 DPP9Q86TI2 863 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJB3Q8WWF6 145 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 DPF3Q92784 378 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 MAML3Q96JK9 1138 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 NUF2Q9BZD4 464 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 Q9H521 79 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS3-201ENST00000355530 TADA2AO75478 443 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 POLD2P49005 469 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 THOP1P52888 689 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 NAGLUP54802 743 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 COG7P83436 770 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 FOLH1Q04609 750 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RAB41Q5JT25 222 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ARRDC4Q8NCT1 418 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RCN3Q96D15 328 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.52■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN8A6NHC0 703 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 JCHAINP01591 159 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SAT1P21673 171 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GLRBP48167 497 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 DLG3Q92796 817 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 SMOQ99835 787 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 WDCPQ9H6R7 721 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 UBP1Q9NZI7 540 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 TARM1B6A8C7 271 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 PTGESO14684 152 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CACNG3O60359 315 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 LRIG2O94898 1065 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 USP17L7P0C7H9 530 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS3-201ENST00000355530 CXCR3P49682 368 aa18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms