RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT8P05787 483 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMA3P25788 255 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R40P59535 323 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNA10Q16322 511 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPNS2Q96L46 248 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 QRFPRQ96P65 431 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MRASO14807 208 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN1O60635 241 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF19O95750 216 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1B2P21281 511 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CCT8P50990 548 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 INSCQ1MX18 579 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEHQ6S545 545 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF786Q8N393 782 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRN4CLQ8ND94 238 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BBS2Q9BXC9 721 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCY1B2O75343 617 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF1P05230 155 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PBX1P40424 430 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK18Q07002 472 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2E3Q969T4 207 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LGMNQ99538 433 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRA1BP35368 520 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF8Q02556 426 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 VAC14Q08AM6 782 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRR2P28476 465 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL14P50914 215 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PRMT2P55345 433 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MREGQ8N565 214 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC154A6NI56 674 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPAP49450 140 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP4Q13115 394 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DUPD1Q68J44 220 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ART4Q93070 314 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SHPRHQ149N8 1683 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC166P0CW27 439 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMC3P17980 439 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CRADDP78560 199 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ELMO1Q92556 727 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG9Q9H6U8 611 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN11O75508 207 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TNNI3P19429 210 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ABL2P42684 1182 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK2P51955 445 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX8Q9Y5X2 465 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLUHO75153 1309 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FASP25445 335 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BLVRAP53004 296 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS45Q9NRW7 570 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A3P33764 101 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK9P45984 424 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 NAGLUP54802 743 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF10Q12962 218 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 TBCELQ5QJ74 424 aa16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM84AQ96KN4 292 aa16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms