RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 TAC4Q86UU9 113 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CEP97Q8IW35 865 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 LSMEM2Q8N112 164 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 CDRT15Q96T59 188 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 F2P00734 622 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 MYL3P08590 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MYL4P12829 197 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 CDK7P50613 346 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 INHBEP58166 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A2Q01362 244 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MFSD10Q14728 455 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 MMEL1Q495T6 779 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 XKR4Q5GH76 650 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 FSCBQ5H9T9 825 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 JADE3Q92613 823 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 RNF34Q969K3 372 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 NXNL1Q96CM4 212 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 PDP2Q9P2J9 529 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 TLK1Q9UKI8 766 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 MYLKQ15746 1914 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 C9IYK1 514 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 HHLA1C9JL84 531 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 GABRDO14764 452 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 DLX3O60479 287 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO21O94952 628 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 PGM3O95394 542 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 MT-CO1P00395 513 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CTSHP09668 335 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 SPATA31D3P0C874 917 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 HDCP19113 662 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 ARNTP27540 789 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 GSTT1P30711 240 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 ALDH1A3P47895 512 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 PGFP49763 221 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 PSEN2P49810 448 aa7.38□□□□□ -1.23
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