RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SARDHQ9UL12 918 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 EML5Q05BV3 1969 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NUMA1Q14980 2115 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 APOL1O14791 398 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NPC1O15118 1278 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MUSKO15146 869 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ZSCAN12O43309 604 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CTSLP07711 333 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NNMTP40261 264 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 RGRP47804 291 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 GALNT2Q10471 571 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CYTH1Q15438 398 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 RASSF3Q86WH2 238 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 VSIG1Q86XK7 387 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 KDM1BQ8NB78 822 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM58Q8NG06 486 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 DONSONQ9NYP3 566 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 PLK4O00444 970 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 FANCGO15287 622 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 APBB3O95704 486 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 KCNA4P22459 653 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CXCR5P32302 372 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB6P35237 376 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 STARD3Q14849 445 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 PGBD3Q8N328 593 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SP110Q9HB58 689 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 LHX3Q9UBR4 397 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SUN2Q9UH99 717 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 R4GN57 208 aa9.26□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK1O00180 336 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NRLP54845 237 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 IL10RBQ08334 325 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SLC20A2Q08357 652 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 RPS6KA1Q15418 735 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 PPP2R5EQ16537 467 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 BBS12Q6ZW61 710 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 PGBD5Q8N414 524 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 OR2T3Q8NH03 318 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 NELL1Q92832 810 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 OLFM3Q96PB7 478 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 WDR24Q96S15 920 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CEP41Q9BYV8 373 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 KCNK3O14649 394 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MCF2LO15068 1137 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 AXIN1O15169 862 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 INSIG1O15503 277 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 HRO43593 1189 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 HOXA6P31267 233 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CLCN6P51797 869 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 COPS2P61201 443 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 MAXP61244 160 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 IHHQ14623 411 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-201ENST00000309641 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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