RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 CREB3O43889 395 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RASSF9O75901 435 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 UBOX5O94941 541 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKCHP24723 683 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ADRA1BP35368 520 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C11orf91Q3C1V1 193 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GALNTL6Q49A17 601 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB41Q5JT25 222 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PPM1NQ8N819 430 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC63Q8NA47 563 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC16Q8NEE8 873 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SERAC1Q96JX3 654 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA13Q96N96 652 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CD320Q9NPF0 282 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OBSL1O75147 1896 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD11O43934 449 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ASGR2P07307 311 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ADRA1DP25100 572 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FDFT1P37268 417 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SARNPP82979 210 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC18A2Q05940 514 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC6Q86X45 466 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC22A12Q96S37 553 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TASP1Q9H6P5 420 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 COMMD8Q9NX08 183 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GDE1Q9NZC3 331 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SCML2Q9UQR0 700 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.17■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PQH9 124 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM92AA1XBS5 289 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM155BO75949 473 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 APOEP02649 317 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GRIA1P42261 906 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK16Q00536 496 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 AP1B1Q10567 949 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 DPYSQ14117 519 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PDK1Q15118 436 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PARM1Q6UWI2 310 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NETO2Q8NC67 525 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PDZD8Q8NEN9 1154 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FGF14Q92915 247 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 P2RY11Q96G91 374 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NMUR1Q9HB89 426 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 DENND4CQ5VZ89 1909 aa16.16■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR91A4D1P6 747 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 PYGBP11216 843 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 VIPR2P41587 438 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MNAT1P51948 309 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 AIF1P55008 147 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MGAT5Q09328 741 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 LGSNQ5TDP6 509 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RFX8Q6ZV50 586 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 GJD3Q8N144 294 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 MPP5Q8N3R9 675 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF276Q8N554 614 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FITM2Q8N6M3 262 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CCNYQ8ND76 341 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAM32Q8TC27 787 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ASB16Q96NS5 453 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 KXD1Q9BQD3 176 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS11Q9H270 941 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 KLC4Q9NSK0 619 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OSER1Q9NX31 292 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF103O00237 685 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 OPHN1O60890 802 aa16.15■□□□□ 0.18
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT37O76014 449 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms