RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 JCADQ9P266 1359 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RCCD1A6NED2 376 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB14O43829 449 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL15Q9NXU5 204 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNI3P19429 210 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 DGKAP23743 735 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC42P60953 191 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BST1Q10588 318 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC38Q5VT99 294 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC23Q5W5X9 447 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 COG5Q9UP83 839 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN1P07384 714 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC166P0CW27 439 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL4P12829 197 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP5P51878 434 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 KLQ9UEF7 1012 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGAVP06756 1048 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 DUPD1Q68J44 220 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 MZT2AQ6P582 158 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 IKBIPQ70UQ0 350 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CRATP43155 626 aa24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PTSQ03393 145 aa24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 STK40Q8N2I9 435 aa24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPSLQ8WWF8 208 aa24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa24.45■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1C1P21283 382 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 MZT2BQ6NZ67 158 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf186Q6ZWK4 172 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 BAP1Q92560 729 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 AK9Q5TCS8 1911 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA6P08185 405 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL2L1Q07817 233 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ACOX1Q15067 660 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP20A1Q6UW02 462 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB3Q8N7B9 438 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PRELID2Q8N945 189 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PGLYRP2Q96PD5 576 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ACP6Q9NPH0 428 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB41L1Q9H4G0 881 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.45■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF21O75509 655 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL5P46777 297 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 IDH2P48735 452 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 POLD2P49005 469 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGAXP20702 1163 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 AXLP30530 894 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ADI1Q9BV57 179 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHB6O15197 1021 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX11AO75192 247 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 DDI2Q5TDH0 399 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 SPON1Q9HCB6 807 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ASTN1O14525 1302 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP3A4P08684 503 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF410Q86VK4 478 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF671Q8TAW3 534 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO1Q9UM00 188 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 NWD1Q149M9 1564 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BMM5 538 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT8BQ93098 351 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 GMPPBQ9Y5P6 360 aa24.44■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.43■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.43■■□□□ 1.5
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms