RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 MFSD11O43934 449 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.51■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.51■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 GSRP00390 522 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 MLNP12872 115 aa20.51■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 DEFB106AQ8N104 65 aa20.51■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.5■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 THRAP10827 490 aa20.5■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 CPOXP36551 454 aa20.5■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.49■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 GPR162Q16538 588 aa20.49■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 HACE1Q8IYU2 909 aa20.49■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 RNF103O00237 685 aa20.48■□□□□ 0.87
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HPS6-201ENST00000299238 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 WWP1Q9H0M0 922 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 H3BNX3 289 aa20.47■□□□□ 0.87
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