RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK7Q16549 785 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SRLQ86TD4 932 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0D9SEW6 157 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CCNFP41002 786 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ETV4P43268 484 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 EPHB3P54753 998 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IL10RBQ08334 325 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 NAB1Q13506 487 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 POU6F1Q14863 301 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CGB2Q6NT52 195 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TEX26Q8N6G2 289 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP2Q99490 1192 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZBP1Q9H171 429 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CNTFP26441 200 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ETFBP38117 255 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA4P43681 627 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SGSHP51688 502 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PGBD5Q8N414 524 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KIFC1Q9BW19 673 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CARNS1A5YM72 827 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CNPP09543 421 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 WNT3AP56704 352 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 DSC2Q02487 901 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IHHQ14623 411 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KDELC1Q6UW63 502 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RANBP10Q6VN20 620 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 H3BNC9 293 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CD86P42081 329 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 MPP3Q13368 585 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 FIBCD1Q8N539 461 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A12Q96S37 553 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.11■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 MMP2P08253 660 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA2BP08514 1039 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CTSAP10619 480 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 GP5P40197 560 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PPP3CCP48454 512 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PCID2Q5JVF3 399 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KCNMB4Q86W47 210 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TGM5O43548 720 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN3O60637 253 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF11O60813 436 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 FGBP02675 491 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 F11P03951 625 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ALADP13716 330 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CDH4P55283 916 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 OR7D4Q8NG98 312 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 BADQ92934 168 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 AZIN2Q96A70 460 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CPNE1Q99829 537 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 VPS11Q9H270 941 aa23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.1■■□□□ 1.29
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