RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP5-201ENST00000294304 SYBUQ9NX95 663 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP5-201ENST00000294304 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP5-201ENST00000294304 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.52■■□□□ 1.04
LRP5-201ENST00000294304 ALBP02768 609 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTPN3P26045 913 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PIRTP0C851 137 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CDKN2BP42772 138 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 IRGQQ8WZA9 623 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 UNCXA6NJT0 531 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 GLUD1P00367 558 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PIGRP01833 764 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NAGLUP54802 743 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 WNT3AP56704 352 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TMED1Q13445 227 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CRY1Q16526 586 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PLD5Q8N7P1 536 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PCED1BQ96HM7 432 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HGH1Q9BTY7 390 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CYLDQ9NQC7 956 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTPN9P43378 593 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.51■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 LGR5O75473 907 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 VNN1O95497 513 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 INHAP05111 366 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 GBE1Q04446 702 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTP4A2Q12974 167 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 STK32AQ8WU08 396 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ARMCX1Q9P291 453 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 OPTCQ9UBM4 332 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PMM2O15305 246 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SPATA31D3P0C874 917 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MLNP12872 115 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TYMPP19971 482 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 POTEHQ6S545 545 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ARL15Q9NXU5 204 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CDC25CP30307 473 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 DOK6Q6PKX4 331 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 BBS2Q9BXC9 721 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ITGA2BP08514 1039 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 HSPA13P48723 471 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TTPAP49638 278 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.5■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 DCXO43602 365 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PIK3CGP48736 1102 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NCALDP61601 193 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PFKFB4Q16877 469 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 GLOD4Q9HC38 313 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CAPN10Q9HC96 672 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ITM2BQ9Y287 266 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 ZNF23P17027 643 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TEX44Q53QW1 395 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 FUT10Q6P4F1 479 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TTC7BQ86TV6 843 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MIEF1Q9NQG6 463 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 AHSPQ9NZD4 102 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MDM4O15151 490 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 MAP3K13O43283 966 aa21.49■■□□□ 1.03
LRP5-201ENST00000294304 SEC22BO75396 215 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms