RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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CUX1-201ENST00000292535 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 SLC9A7Q96T83 725 aa9.45□□□□□ -0.9
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CUX1-201ENST00000292535 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
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CUX1-201ENST00000292535 LTFP02788 710 aa9.43□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 CLUP10909 449 aa9.43□□□□□ -0.9
CUX1-201ENST00000292535 ME2P23368 584 aa9.43□□□□□ -0.9
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