RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 OMDQ99983 421 aa17.84■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 XPR1Q9UBH6 696 aa17.84■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 RPTORQ8N122 1335 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 UNGP13051 313 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 SERPINB1P30740 379 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 RIPK1Q13546 671 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM16LQ309B1 348 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 STK32CQ86UX6 486 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 C10orf107Q8IVU9 208 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 DHRSXQ8N5I4 330 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 FAM45AQ8TCE6 357 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 CIPCQ9C0C6 399 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 ZYG11BQ9C0D3 744 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 COL1A2P08123 1366 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 SEC22BO75396 215 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 KRT8P05787 483 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 RAP1GAP2Q684P5 730 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 NETO2Q8NC67 525 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 DYRK1BQ9Y463 629 aa17.83■□□□□ 0.45
SCARB2-201ENST00000264896 BUD23O43709 281 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CDC16Q13042 620 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CTBP1Q13363 440 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FITM2Q8N6M3 262 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MTMR14Q8NCE2 650 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GPR25O00155 361 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 C11orf96Q7Z7L8 435 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 UCMAQ8WVF2 138 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TFAP2BQ92481 460 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 UROC1Q96N76 676 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 LIMD1Q9UGP4 676 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa17.83■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 IFNA14P01570 189 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PAX7P23759 505 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DHDDSQ86SQ9 333 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ULK2Q8IYT8 1036 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PANX3Q96QZ0 392 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ARL8BQ9NVJ2 186 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SELENONQ9NZV5 590 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 C2P06681 752 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ANPEPP15144 967 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 EPHA3P29320 983 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 HK2P52789 917 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PSME3P61289 254 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP8P85298 464 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 BCL2L1Q07817 233 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TP53BP2Q13625 1128 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TDRPQ86YL5 185 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SEMA3CQ99985 751 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 UGT2B28Q9BY64 529 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 EPS8L2Q9H6S3 715 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PACSIN3Q9UKS6 424 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FGFR1P11362 822 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DARSP14868 501 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CYP2A7P20853 494 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CRHR1P34998 444 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MAP2K5Q13163 448 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FNBP1LQ5T0N5 605 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SLC26A9Q7LBE3 791 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM13CQ8NE31 585 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MCOLN3Q8TDD5 553 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MSH3P20585 1137 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GPC1P35052 558 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 STXBP5Q5T5C0 1151 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 YME1L1Q96TA2 773 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 RHOJQ9H4E5 214 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.82■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1C1P21283 382 aa17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms