RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260795.6

FGFR3-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR3, Length 4,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3-201ENST00000260795 GABRB2P47870 512 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CD151P48509 253 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 WASHC5Q12768 1159 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 IMPG1Q17R60 797 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 APBB2Q92870 758 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 NENFQ9UMX5 172 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 STK25O00506 426 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SIN3BO75182 1162 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TM7SF2O76062 418 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 GEMP55040 296 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TBX4P57082 545 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SATB1Q01826 763 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ARCQ7LC44 396 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CALML6Q8TD86 181 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SCLYQ96I15 445 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 PEBP4Q96S96 227 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 WDR41Q9HAD4 459 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 XPR1Q9UBH6 696 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 LRP5O75197 1615 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TYROBPO43914 113 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 WFS1O76024 890 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TSHRP16473 764 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 GMPRP36959 345 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 INPP5AQ14642 412 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 AGAP2Q99490 1192 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 DTLQ9NZJ0 730 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.59□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 F5H5T6 163 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 BAIAP3O94812 1187 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 URODP06132 367 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 YWHAQP27348 245 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CRHR1P34998 444 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 CCDC142Q17RM4 750 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 C16orf87Q6PH81 154 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SNX31Q8N9S9 440 aa14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
FGFR3-201ENST00000260795 SCN7AQ01118 1682 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 HACD1B0YJ81 288 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 ITM2AO43736 263 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 LRG1P02750 347 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 NFKBIAP25963 317 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 GALNTL6Q49A17 601 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 MPP4Q96JB8 637 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 HSFY1Q96LI6 401 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 ZBTB18Q99592 522 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 POMKQ9H5K3 350 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 VPS28Q9UK41 221 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 MPOP05164 745 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 GRK4P32298 578 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 CDH13P55290 713 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 DUSP4Q13115 394 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 UNC93AQ86WB7 457 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 IFNL1Q8IU54 200 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 CD274Q9NZQ7 290 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 COPG2Q9UBF2 871 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 SIX4Q9UIU6 781 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 GABRQQ9UN88 632 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.58□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 CITO14578 2027 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 PLIN3O60664 434 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 CCNB1P14635 433 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 SLC11A2P49281 568 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 PLD1Q13393 1074 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 FAM35AQ86V20 835 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 VPS50Q96JG6 964 aa14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
FGFR3-201ENST00000260795 PLK2Q9NYY3 685 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms