RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 KIF3CO14782 793 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CCDC22O60826 627 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TBX18O95935 607 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 C2P06681 752 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RHOQP17081 205 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CALB2P22676 271 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GRK2P25098 689 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 NDST2P52849 883 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ARPP19P56211 112 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PSMD5Q16401 504 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 POTEHQ6S545 545 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GPR22Q99680 433 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CREBZFQ9NS37 354 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ARMCX1Q9P291 453 aa20.01■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PMPCBO75439 489 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 WFS1O76024 890 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CPB1P15086 417 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CPA3P15088 417 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CSRP3P50461 194 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CDK7P50613 346 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 IRF9Q00978 393 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 FAM13CQ8NE31 585 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 HCSTQ9UBK5 93 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PHF24Q9UPV7 400 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MTMR11A4FU01 709 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 NEBLO76041 1014 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ALDH2P05091 517 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 HADHAP40939 763 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SLC11A1P49279 550 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GRM3Q14832 879 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 DEFB115Q30KQ5 88 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ALFQ53S48 1182 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RANBP10Q6VN20 620 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ATG14Q6ZNE5 492 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 BTBD10Q9BSF8 475 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CRISPLD1Q9H336 500 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RHOJQ9H4E5 214 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CAPN14A8MX76 684 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CNTN5O94779 1100 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 VNN2O95498 520 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RALBP11234 206 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 PSEN1P49768 467 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TAF10Q12962 218 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GPR17Q13304 367 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 E2F5Q15329 346 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TNS4Q8IZW8 715 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 FATE1Q969F0 183 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 HMCESQ96FZ2 354 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SORT1Q99523 831 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 EBF4Q9BQW3 602 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 CCND1P24385 295 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ARNTP27540 789 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ARRB2P32121 409 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 BFSP2Q13515 415 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ITGA9Q13797 1035 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MGAT5BQ3V5L5 792 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 RASIP1Q5U651 963 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 FUT10Q6P4F1 479 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MIB1Q86YT6 1006 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SPPL2BQ8TCT7 592 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SLC25A51Q9H1U9 297 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 MARCH2Q9P0N8 246 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.99■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 TBC1D4O60343 1298 aa19.98■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GNRH1P01148 92 aa19.98■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RTKN-201ENST00000233330 GABRB3P28472 473 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms