RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 GRIA4P48058 902 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 NTAN1Q96AB6 310 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SKA1Q96BD8 255 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CNPY3Q9BT09 278 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 DYRK4Q9NR20 520 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 A0A1W2PPC4 97 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SLC7A4O43246 635 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 LRIG2O94898 1065 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ZNF883P0CG24 379 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 GLDCP23378 1020 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 MAPKAPK2P49137 400 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 C21orf59P57076 290 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SLC20A2Q08357 652 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 NR1I3Q14994 352 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 HLA-BQ31612 363 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 PARVAQ9NVD7 372 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 DNAI1Q9UI46 699 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SARDHQ9UL12 918 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.23■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FAM72CH0Y354 149 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 PLK4O00444 970 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 RTN2O75298 545 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 PRNPP04156 253 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CHRNA3P32297 505 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 DRD3P35462 400 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 DNA2P51530 1060 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CCR5P51681 352 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 METAP1P53582 386 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FANCCQ00597 558 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CNTN1Q12860 1018 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 KIF19Q2TAC6 998 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 MANEALQ5VSG8 457 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 FAM72BQ86X60 149 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.22■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 RAMP2O60895 175 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 AIF1P55008 147 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 UBASH3AP57075 661 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 LAYNQ6UX15 382 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TMC6Q7Z403 805 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SLC6A18Q96N87 628 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 EPAS1Q99814 870 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SYT11Q9BT88 431 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CEP44Q9C0F1 390 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.21■■□□□ 1.15
NME4-201ENST00000219479 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 CREB3O43889 395 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 PSMA2P25787 234 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 EPHB2P29323 1055 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 L1CAMP32004 1257 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 MAMLD1Q13495 774 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 ARTNQ5T4W7 220 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 NLRP14Q86W24 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 TMIEQ8NEW7 156 aa22.2■■□□□ 1.14
NME4-201ENST00000219479 MDM1Q8TC05 714 aa22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms