RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ampd1Q3V1D3 745 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cldn11Q60771 207 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtnr1aQ61184 353 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlgn2Q69ZK9 836 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem220Q8BP07 167 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RtknQ8C6B2 564 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdha6Q91Y14 946 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q922M7 232 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pidd1Q9ERV7 915 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tspan3Q9QY33 253 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grm3Q9QYS2 879 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nphs1Q9QZS7 1256 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700001O22RikA2APZ1 375 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akain1G3UWD5 69 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr743L7N1Y2 311 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ak8Q32M07 479 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 UrgcpQ5NCI0 926 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ScinQ60604 715 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q6GQU0 248 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubxn7Q6P5G6 467 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Maml1Q6T264 1020 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc18a2Q8BRU6 517 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rap2cQ8BU31 183 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wwp1Q8BZZ3 918 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gfm2Q8R2Q4 779 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppa2Q91VM9 330 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tcf7l2Q924A0 459 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc30a1Q99J38 664 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akr1c12Q9JLI0 323 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gbp2Q9Z0E6 589 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4931406B18RikA2RSL7 367 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm8369E9PZI3 166 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dsg3O35902 993 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fen1P39749 378 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smad1P70340 465 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dab2P98078 766 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HmgcrQ01237 887 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrlrQ08501 608 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tekt4Q149S1 447 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hbq1bQ3U0A6 142 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Heatr9Q5QNV8 569 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xlr3cQ61806 226 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem151aQ6GQT5 468 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpp38Q80UU2 280 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrc27Q80YS5 523 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ofcc1Q8BGX4 166 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LipmQ8K2A6 422 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn1r203Q8R273 311 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp566Q8VCI1 386 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FtcdQ91XD4 541 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf181Q9CY62 165 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hddc3Q9D114 179 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap2b1Q9DBG3 937 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pi16Q9ET66 489 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slfn2Q9Z0I6 378 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef37A1IGU4 676 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm12800B1AUV4 484 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtproE9Q612 1226 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2j12G3UXT0 502 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r19G5E8G4 854 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm12794L7MTS5 483 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chil3O35744 398 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gdf7P43029 461 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mc1rQ01727 315 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr15Q0VDU3 360 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam83fQ3UKU4 495 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 StyxQ60969 223 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp9cQ66X01 1004 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr698Q7TRN4 311 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbx10Q810F8 385 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mapkap1Q8BKH7 522 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Serpina3bQ8BYY9 420 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fnbp1lQ8K012 605 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930513O06RikQ9D549 161 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scamp5Q9JKD3 235 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1049A2ARZ0 308 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1023A2ASU6 311 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calhm3J3QMI4 347 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6408J3QNG1 320 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3402K7N5P2 326 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3739L7N296 216 aa18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Matn1P51942 500 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.1 ms