RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026296.7

Fgd1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fgd1, Length 4,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mtx3D3YTP3 312 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf683I7HJS4 458 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 LmnaP48678 665 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Smpdl3bP58242 456 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Morf4l1P60762 362 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q14AM7 275 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Nab1Q61122 486 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Abhd10Q6PE15 297 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Svs3bQ8BZH8 265 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmed5Q9CXE7 229 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PirQ9D711 290 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rab27aQ9ERI2 221 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cdh22Q9WTP5 813 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ptar1E9QAB6 424 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm7942L7N277 499 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tpst1O70281 370 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 GaaP70699 953 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc16a10Q3U9N9 512 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ntrk1Q3UFB7 799 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mkl1Q8K4J6 964 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Map3k21Q8VDG6 1002 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Il21rQ9JHX3 529 aa14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ptchd4B9EKX1 904 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vmn2r59E9PUT5 865 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyp2c65Q148B1 490 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Grb10Q60760 621 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Abcd2Q61285 741 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Far2Q7TNT2 515 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Olfr412Q7TRW7 312 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 OsgepQ8BWU5 335 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccdc63Q8CDV6 558 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Q922M7 232 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 LrgukQ9D5S7 820 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Eif4e3Q9DBB5 207 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Zbed5B2RPU8 756 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pate3B3GLJ3 98 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vmn2r74E9PW21 853 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ptpn9O35239 593 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Itga3Q62470 1053 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Abcg2Q7TMS5 657 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Slc18a2Q8BRU6 517 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Trim7Q923T7 510 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tmem86aQ9D8N3 241 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Scnn1bQ9WU38 638 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Bscl2Q9Z2E9 383 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 GnazO70443 355 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 DmpkP54265 631 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ephx4Q6IE26 359 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ppm1lQ8BHN0 360 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Noc4lQ8BHY2 516 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Znf668Q8K2R5 619 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vmn1r214Q8R279 367 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 GsdmcQ99NB5 468 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Btbd19S4R1I0 287 aa14.61□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cylc2B1AWN8 422 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 9230113P08RikD3YWX3 137 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm7971J3QMM8 481 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 C2P21180 760 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Itga11P61622 1188 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 RgnQ64374 299 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Vmn1r203Q8R273 311 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ddx59Q9DBN9 619 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 NmbrO54799 390 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ptchd3Q0EEE2 906 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Mtmr12Q80TA6 747 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Ccdc151Q8BSN3 593 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Rnf31Q924T7 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Cybrd1Q925G2 290 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Tagln3Q9R1Q8 199 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Gm2832F7AEC7 200 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 SpnP15702 395 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Inpp1P49442 396 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Wbp4Q61048 376 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 GnsQ8BFR4 544 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Kansl2Q8BQR4 486 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Snx16Q8C080 344 aa14.6□□□□□ -0.07
Fgd1-201ENSMUST00000026296 Snapc1Q8K0S9 389 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.5 ms