RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spta1P08032 2415 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med13Q5SWW4 2171 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tns1E9Q0S6 1888 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr742A2RTP5 311 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnbd1B1AWM0 430 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lce6aD3YV94 81 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3jD3Z451 420 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr414E9Q5P8 317 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5689F6Y2A6 97 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Susd5G3UW60 619 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epha8O09127 1004 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmx1O70218 332 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ceacam1P31809 521 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actn4P57780 912 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bach2P97303 839 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam172aQ3TNH5 417 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp51Q3U4L8 781 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mex3dQ3UE17 643 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zyg11bQ3UFS0 744 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo39Q5NBU5 443 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspa4Q61316 841 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfaip2Q61333 691 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HrQ61645 1182 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baiap3Q80TT2 1134 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap4e1Q80V94 1122 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc27Q80YS5 523 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl30Q8C3F7 581 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UvragQ8K245 698 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brd8Q8R3B7 951 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srgap2Q91Z67 1071 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ak5Q920P5 562 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubqln5Q9D4I8 510 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ovca2Q9D7E3 225 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina1fQ9DCQ7 411 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lhx6Q9R1R0 363 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il18bpQ9Z0M9 193 aa11.41□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YCH8 300 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YE43 300 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcte1A6H639 498 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm15821A6X8J8 139 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp952B0V2W4 504 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgap42B2RQE8 841 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3594E9Q2A7 267 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akain1G3UWD5 69 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap73J3QPZ5 306 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r67K7N6T2 851 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arg2O08691 354 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PbsnO08976 174 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Diaph2O70566 1098 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfy2P20662 777 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TubP50586 505 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UrosP51163 265 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam47cQ14BE7 430 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnks2Q3UES3 1166 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erich4Q3UNU4 136 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpdyaQ5IBH7 310 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam9Q61072 845 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema4aQ62178 760 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RalyQ64012 312 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mpp7Q8BVD5 576 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem72Q8C3K5 275 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spdye4bQ8CDE8 236 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PvrQ8K094 408 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr98Q8VC42 657 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epsti1Q8VDI1 314 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asb18Q8VHA6 467 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asic2Q925H0 512 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trps1Q925H1 1281 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MpstQ99J99 297 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clcc1Q99LI2 539 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9CQC3 228 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apopt1Q9CQW7 192 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anks3Q9CZK6 655 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phf14Q9D4H9 881 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Poc5Q9DBS8 558 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kat2bQ9JHD1 813 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IvdQ9JHI5 424 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Socs6Q9JLY0 533 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim10Q9WUH5 489 aa11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YD13 301 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r94E9PZK8 818 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M9O19442 342 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bhlhe40O35185 411 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArafP04627 604 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RxrgP28705 463 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Casp4P70343 373 aa11.39□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hif3aQ0VBL6 662 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.2 ms