RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 C11orf74Q86VG3 221 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 PIGKQ92643 395 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 KAT5Q92993 513 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 USP7Q93009 1102 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 CLIC5Q9NZA1 410 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-211ENST00000641106 F8W735 103 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 O00370 1275 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 RGS13O14921 159 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GPR39O43194 453 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 AKAP10O43572 662 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ENGP17813 658 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SPINK2P20155 84 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SSTR4P31391 388 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 IL12RB1P42701 662 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SGSHP51688 502 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 EFEMP1Q12805 493 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CUL2Q13617 745 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.227e-9■■■□□ 15.9
CASC19-211ENST00000641106 STAT4Q14765 748 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ST3GAL2Q16842 350 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 FUT11Q495W5 492 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 C14orf80Q86SX3 495 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SYT12Q8IV01 421 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 PASD1Q8IV76 773 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 LMO3Q8TAP4 145 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TFAP2BQ92481 460 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GSDMAQ96QA5 445 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TTC1Q99614 292 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 PI4KAP42356 2102 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SLC12A8A0AV02 714 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 KCNJ18B7U540 433 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 E7ENQ6 273 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CETN3O15182 167 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 AP5Z1O43299 807 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 PPM1BO75688 479 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ZBED1O96006 694 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 RALAP11233 206 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 PRKCHP24723 683 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 FMO5P49326 533 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 COPAP53621 1224 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 BCAT1P54687 386 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GABREP78334 506 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 TMPRSS15P98073 1019 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ZNF33AQ06730 810 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ADIGQ0VDE8 80 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 LRMPQ12912 555 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SEMA3BQ13214 749 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ZNF234Q14588 700 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CASC19-211ENST00000641106 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms