RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PER2	O15055	1255 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ATG13	O75143	517 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	F9	P00740	461 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ADA	P00813	363 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PTPN9	P43378	593 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF91	Q05481	1191 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PMPCA	Q10713	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CAMK1	Q14012	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GPR68	Q15743	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NFIL3	Q16649	462 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO43	Q4G163	708 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	AAGAB	Q6PD74	315 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	C17orf99	Q6UX52	265 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM74	Q86UV6	250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM73	Q86UV7	250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MON1A	Q86VX9	555 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC25	Q86WR0	208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CNGA4	Q8IV77	575 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	EME1	Q96AY2	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	EYA3	Q99504	573 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PREB	Q9HCU5	417 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RNF146	Q9NTX7	359 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NLK	Q9UBE8	527 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175		B4E171	279 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	STRN	O43815	780 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SH3BP5	O60239	455 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SERPINC1	P01008	464 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	CD4	P01730	458 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	UROD	P06132	367 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	CD72	P21854	359 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	KLRC2	P26717	231 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	ABCD3	P28288	659 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	ELF1	P32519	619 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	CIITA	P33076	1130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SLC16A2	P36021	539 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	TSPAN7	P41732	249 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	PTP4A2	Q12974	167 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	MTX1	Q13505	466 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	NAA25	Q14CX7	972 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC142	Q17RM4	750 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	MTX3	Q5HYI7	312 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	KDM1B	Q8NB78	822 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	RFFL	Q8WZ73	363 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	HSPH1	Q92598	858 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	APOPT1	Q96IL0	206 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATRX-223	ENST00000637175	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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