RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ETFBP38117 255 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 LMAN1P49257 510 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 MARC1Q5VT66 337 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF534Q76KX8 674 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 NINJ2Q9NZG7 142 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD11Q693B1 232 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDH22Q9UJ99 828 aa25.37■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 NFS1Q9Y697 457 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO9BQ13459 2157 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC29A2Q14542 456 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED8Q8IZ13 594 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF13Q92913 245 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf72Q96LT7 481 aa25.36■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR51B4Q9Y5P0 310 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPC1 479 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 AVILO75366 819 aa25.35■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 NEBLO76041 1014 aa25.35■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 ASB16Q96NS5 453 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 FEM1AQ9BSK4 669 aa25.35■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 BBS9Q3SYG4 887 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC8BQ6P9F7 803 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTC25Q96NG3 672 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.34■■□□□ 1.65
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CAPNS1-215ENST00000628018 NT5MQ9NPB1 228 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 GDE1Q9NZC3 331 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL3Q9Y4R7 772 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD3O43242 534 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 CSKP41240 450 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 NUMBP49757 651 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 MTM1Q13496 603 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCD2Q92925 531 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF7Q92985 503 aa25.33■■□□□ 1.65
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