RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 VCANP13611 3396 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KRBA1A5PL33 1030 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SHISA7A6NL88 538 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 K7EQS6 105 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KRIT1O00522 736 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MAN2B1O00754 1011 aa8.69□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LIASO43766 372 aa8.69□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 RETSATQ6NUM9 610 aa8.69□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 A0A0A0MRY4 1105 aa8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 MATN3O15232 486 aa8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 CCNG2Q16589 344 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PROX2Q3B8N5 592 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PRELID2Q8N945 189 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SHDQ96IW2 340 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TSGA13Q96PP4 275 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PDFQ9HBH1 243 aa8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.68□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 K7ERQ8 282 aa8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KCNK1O00180 336 aa8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KCNN4O15554 427 aa8.67□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
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