RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CISD3P0C7P0 127 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 GBP1P32455 592 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CHKAP35790 457 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MNAT1P51948 309 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2R2AP63151 447 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf228Q6PIY5 440 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52K2Q8NGK3 314 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 RXFP2Q8WXD0 754 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 IGSF8Q969P0 613 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MCEEQ96PE7 176 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR6Q9Y2C9 796 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 BNIP3LO60238 219 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTN5O94779 1100 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 FSBPO95073 299 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CYBBP04839 570 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 UNGP13051 313 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFAIP3P21580 790 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP8P22894 467 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC11A2P49281 568 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CCR3P51677 355 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 QPCTQ16769 361 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 EFHC1Q5JVL4 640 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MSANTD2Q6P1R3 559 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC26A9Q7LBE3 791 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MFN1Q8IWA4 741 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 FMO2Q99518 471 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP2Q9H0W7 228 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 ETAA1Q9NY74 926 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 GMNCA6NCL1 334 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PAGE1O75459 146 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 APOEP02649 317 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PDGFRAP16234 1089 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MATKP42679 507 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 DEUP1Q05D60 604 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 MS4A13Q5J8X5 152 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC14L1Q92503 715 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 OTUB2Q96DC9 234 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC39A13Q96H72 371 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A13Q96QE2 648 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PENKP01210 267 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV3-27P01718 113 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM253P0C7T8 217 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 IL12RB1P42701 662 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CRY1Q16526 586 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 NUGGCQ68CJ6 796 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL22Q6P050 247 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 AADACL2Q6P093 401 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 IQCF2Q8IXL9 164 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PYROXD2Q8N2H3 581 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 BTBD6Q96KE9 485 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 DCLK3Q9C098 648 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 HS3ST4Q9Y661 456 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNU1A8MYU2 1149 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 H0Y626 953 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 ENDOD1O94919 500 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXB2P14652 356 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TACR2P21452 398 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 STK19P49842 368 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 DR1Q01658 176 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 PTP4A2Q12974 167 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH18Q13634 790 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 POM121L1PQ3SYA9 428 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 APCDD1Q8J025 514 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG3Q92685 438 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 RETREG1Q9H6L5 497 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 WDCPQ9H6R7 721 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM165Q9HC07 324 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR35Q9P2L0 1181 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-209ENST00000607882 DAB1O75553 588 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT3P12035 628 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 VAV1P15498 845 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CCR1P32246 355 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 OGDHQ02218 1023 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC14Q49A88 953 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 ALFQ53S48 1182 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM182AQ5T1J6 154 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 AGBL2Q5U5Z8 902 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CHST9Q7L1S5 443 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM124AQ86V42 546 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC13Q8IYE1 715 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms