RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RSPH14Q9UHP6 348 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 J3KR12 359 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SARNPP82979 210 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RELL1Q8IUW5 271 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS5Q8N3I7 341 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7D4Q8NG98 312 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP41Q9BYV8 373 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD3O43242 534 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 APRTP07741 180 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB4P28070 264 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 LTBRP36941 435 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPSAP1Q14558 356 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTD1Q8N815 330 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FEM1AQ9BSK4 669 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TXLNGYQ9BZA5 131 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBP4P22692 258 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CD68P34810 354 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL4CP56559 192 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD22Q5VYY1 191 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF4L2Q8NA75 395 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FCRL5Q96RD9 977 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SPON2Q9BUD6 331 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A11Q9BYW1 496 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP14Q9HCL3 533 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51B4Q9Y5P0 310 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM63AO94886 807 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP13P45452 471 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PLK1P53350 603 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LBRQ14739 615 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP8Q14790 479 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 HIF1AQ16665 826 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FSCBQ5H9T9 825 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPUQ71F23 418 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM25Q86YD3 366 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PDIK1LQ8N165 341 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ACDQ96AP0 544 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 BBS2Q9BXC9 721 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT8Q9BYC5 575 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00597Q9H2U6 94 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 VIPAS39Q9H9C1 493 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GLOD4Q9HC38 313 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT6Q9Y6F9 365 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKB1P19838 968 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LMAN1P49257 510 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FAXCQ5TGI0 409 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 USP33Q8TEY7 942 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG14Q96F25 216 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.651e-7■■■□□ 16.1
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH22Q9UJ99 828 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 HEPACAM2A8MVW5 462 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA9O76027 345 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DQB2P05538 268 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 VIPR2P41587 438 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC10A7Q0GE19 358 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6G5CQ5SRR4 150 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 EP400NLQ6ZTU2 488 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SMRP1Q8NCR6 262 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 RSPRY1Q96DX4 576 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC3BQ96PB8 259 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS28Q9UK41 221 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 BRWD1Q9NSI6 2320 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD36A6QL64 1941 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 E7ESA3 106 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MLNP12872 115 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 FCARP24071 287 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CSKP41240 450 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2P54278 862 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 EML3Q32P44 896 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC25Q86WR0 208 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC5Q8TCV5 224 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 BHMTQ93088 406 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A51Q9H1U9 297 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF446Q9NWS9 450 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 PLK2Q9NYY3 685 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 SEPT3Q9UH03 358 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP2K7O14733 419 aa31.59■■■□□ 2.65
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