RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 ZNF670Q9BS34 389 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 DPP3Q9NY33 737 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 PAK5Q9P286 719 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 HESX1Q9UBX0 185 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 USP18Q9UMW8 372 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 KAT6AQ92794 2004 aa6.53□□□□□ -1.36
CLTC-211ENST00000579815 NRCAMQ92823 1304 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C7orf72A4D263 438 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PDHXO00330 501 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TM9SF1O15321 606 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CHADO15335 359 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CD4P01730 458 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 THBDP07204 575 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ASGR2P07307 311 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GJB1P08034 283 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 IQCF3P0C7M6 154 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 IL1R2P27930 398 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PMLP29590 882 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ETFBP38117 255 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MAGEA6P43360 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PTPN9P43378 593 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ACADSBP45954 432 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 XRCC4Q13426 336 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SPARCL1Q14515 664 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LLGL1Q15334 1064 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TMED2Q15363 201 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SPATA21Q7Z572 469 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PDIK1LQ8N165 341 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CPT1BQ92523 772 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAF2Q96CS3 445 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 LRRC39Q96DD0 335 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 C9orf72Q96LT7 481 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TWNKQ96RR1 684 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZWILCHQ9H900 591 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ADAMTS20P59510 1910 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 E5RJQ4 531 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 APOL1O14791 398 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RASSF9O75901 435 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ATP5HO75947 161 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 FAM155BO75949 473 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ASMTLO95671 621 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 F2P00734 622 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 IFNB1P01574 187 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 VTNP04004 478 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ZNF286BP0CG31 522 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 RBP3P10745 1247 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 ALADP13716 330 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 PDGFRAP16234 1089 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 KRT15P19012 456 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-211ENST00000579815 CYP3A5P20815 502 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms