RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 OR7D4Q8NG98 312 aa21.46■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.46■■□□□ 1.03
PPP4C-211ENST00000567642 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1B0GTQ1 180 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PR77 199 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CBX4O00257 560 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 MMP8P22894 467 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GLDCP23378 1020 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CHRNA3P32297 505 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 MYL5Q02045 173 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 STX1AQ16623 288 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 INAVAQ3KP66 663 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC157Q569K6 752 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 AGBL4Q5VU57 503 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARCQ7LC44 396 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 BNIPLQ7Z465 357 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GDF3Q9NR23 364 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.45■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ILVBLA1L0T0 632 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 C10orf142B7Z368 130 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 LATO43561 262 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ENDOD1O94919 500 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GJB6O95452 261 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SDC4P31431 198 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 UBXN1Q04323 297 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RAB6CQ53S08 254 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 DRC7Q8IY82 874 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 DYRK4Q9NR20 520 aa21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TLR4O00206 839 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TNFSF14O43557 240 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ITGAVP06756 1048 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CTSLP07711 333 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CLCN6P51797 869 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC14Q49A88 953 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CHST14Q8NCH0 376 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 FTSJ1Q9UET6 329 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 IGF2RP11717 2491 aa21.43■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 LGALS16A8MUM7 142 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 PRNPP04156 253 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 DNA2P51530 1060 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 STAT4Q14765 748 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RETSATQ6NUM9 610 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM69Q86WT6 500 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TMIEQ8NEW7 156 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARRDC3Q96B67 414 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 PREBQ9HCU5 417 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 IL36AQ9UHA7 158 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 DMTF1Q9Y222 760 aa21.42■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 KRT3P12035 628 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ADRA1BP35368 520 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 NUDT1P36639 197 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 NXPH1P58417 271 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 GNA12Q03113 381 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 SCAPQ12770 1279 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARSIQ5FYB1 569 aa21.41■■□□□ 1.02
PPP4C-211ENST00000567642 ARTNQ5T4W7 220 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms