RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		22.29	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		22.29	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		22.29	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA1B	Q00975	2339 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PLK4	O00444	970 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A4	O43246	635 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CER1	O95813	267 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSL	P07711	333 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RRM1	P23921	792 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM193A	P78312	1265 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	GNA12	Q03113	381 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAP	Q12770	1279 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NR1I3	Q14994	352 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	AGBL4	Q5VU57	503 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LINGO4	Q6UY18	593 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	IGF2R	P11717	2491 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SYCE3	A1L190	88 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BP5	O60239	455 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LRIG2	O94898	1065 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ARF5	P84085	180 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TEAD4	Q15561	434 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LAYN	Q6UX15	382 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		22.27	■■□□□ 1.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CCP110	O43303	1012 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	LAT	O43561	262 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN2	O75298	545 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOQ	P17081	205 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTN1	Q12860	1018 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DRC7	Q8IY82	874 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A18	Q96N87	628 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	MCEE	Q96PE7	176 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX8	Q9HC52	389 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF103	O00237	685 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX4	O00257	560 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CBFA2T3	O75081	653 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CD160	O95971	181 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA3	P32297	505 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCI	P41743	596 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSK	P43235	329 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPKAPK2	P49137	400 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2CB	P62714	309 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2CA	P67775	309 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	OGDH	Q02218	1023 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC20A2	Q08357	652 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NAXD	Q8IW45	347 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TMIE	Q8NEW7	156 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CNPY3	Q9BT09	278 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SPON2	Q9BUD6	331 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		22.25	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT9A	O14904	365 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	VILL	O15195	856 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	BNIP3L	O60238	219 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT1	P04628	370 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP3	P21580	790 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	L1CAM	P32004	1257 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ACVRL1	P37023	503 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R38	P59533	333 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CHST14	Q8NCH0	376 aa		22.24	■■□□□ 1.15

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