RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561059.5

PSME1-208, Transcript of proteasome activator subunit 1, human

TSL 2

Gene PSME1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME1-208	ENST00000561059	SLC7A4	O43246	635 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ITPKB	P27987	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	CHRNA3	P32297	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	FLT3	P36888	993 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	RXRG	P48443	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	CXCR3	P49682	368 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	CLDN2	P57739	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ACAP1	Q15027	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	TSC1	Q92574	1164 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059		E9PAM4	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	YKT6	O15498	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	DNA2	P51530	1060 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME1-208	ENST00000561059	ALOX15B	O15296	676 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	PCDH8	O95206	1070 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	CYP11B1	P15538	503 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	OR1E1	P30953	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	HNF1B	P35680	557 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	UBE2H	P62256	183 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	KRT83	P78385	493 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	OXR1	Q8N573	874 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	EMC1	Q8N766	993 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME1-208	ENST00000561059		A0A087WV48	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms