RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558054.1

IRX3-202, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene IRX3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-202ENST00000558054 MFAP3P55082 362 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 UBASH3AP57075 661 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 IRX4P78413 519 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 NR1I3Q14994 352 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TTC39CQ8N584 583 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TFAP2BQ92481 460 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SHC3Q92529 594 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 OTUB2Q96DC9 234 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CYFIP2Q96F07 1278 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TMEM176AQ96HP8 235 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SPATA17Q96L03 361 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 PNKPQ96T60 521 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 AK5Q9Y6K8 562 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 MYH10P35580 1976 aa10□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ATRXP46100 2492 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 F8VP50 259 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TADA3O75528 432 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 BEST1O76090 585 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 GLDCP23378 1020 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 P2RY2P41231 377 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 GRIA2P42262 883 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TNFRSF4P43489 277 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SLC7A9P82251 487 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TTC30AQ86WT1 665 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 NEK11Q8NG66 645 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 KCNK16Q96T55 309 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SMOQ99835 787 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 DUSP13Q9UII6 198 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 WASF3Q9UPY6 502 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.99□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 C2orf78A6NCI8 922 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 F8VZ95 297 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 K7EQS6 105 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 OPHN1O60890 802 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 KAT7O95251 611 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CFIP05156 583 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SYPP08247 313 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 PAEPP09466 180 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 VDRP11473 427 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ENGP17813 658 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 OPRD1P41143 372 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 MAP3K7CLP57077 242 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 EGR3Q06889 387 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 DEFB124Q8NES8 71 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 UBA3Q8TBC4 463 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 SLC22A12Q96S37 553 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 INVSQ9Y283 1065 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ATP8B3O60423 1300 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.98□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 A0A1W2PQC6 194 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 FAM170AA1A519 330 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 PATE3B3GLJ2 98 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 LEFTY2O00292 366 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 TULP2O00295 520 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 O00370 1275 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 THAP12O43422 761 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 ZNF217O75362 1048 aa9.97□□□□□ -0.81
IRX3-202ENST00000558054 GFPT2O94808 682 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms