RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ERICH1Q86X53 443 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TSC1Q92574 1164 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NT5C3BQ969T7 300 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 C18orf8Q96DM3 657 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NPY6RQ99463 290 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NDST4Q9H3R1 872 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SIX2Q9NPC8 291 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PIGVQ9NUD9 493 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 WDR70Q9NW82 654 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 AK5Q9Y6K8 562 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ACACAQ13085 2346 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 KNTC1P50748 2209 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 APC2O95996 2303 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 A0A087WV48 116 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PQU0 124 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SNAP91O60641 907 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SRGAP2O75044 1071 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PCDH8O95206 1070 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 THEGLP0DJG4 465 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 OR1E1P30953 314 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 AKT2P31751 481 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SCNN1AP37088 669 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 GGCXP38435 758 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 GABRB2P47870 512 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ACADVLP49748 655 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SULT1E1P49888 294 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DNA2P51530 1060 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 IRAK1P51617 712 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SEMG2Q02383 582 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SLC20A2Q08357 652 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 KCNMA1Q12791 1236 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 MAN2A1Q16706 1144 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 VWA3BQ502W6 1294 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ALFQ53S48 1182 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RETSATQ6NUM9 610 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HORMAD1Q86X24 394 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NXPE2Q96DL1 559 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FEM1CQ96JP0 617 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HAPLN3Q96S86 360 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TBCBQ99426 244 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PSMB7Q99436 277 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SPON2Q9BUD6 331 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 MPP6Q9NZW5 540 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 VPS51Q9UID3 782 aa8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ITPR1Q14643 2758 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 A0A0D9SEW6 157 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ILVBLA1L0T0 632 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 NEMP2A6NFY4 417 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 K7ERQ8 282 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 SDC3O75056 442 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ENDOD1O94919 500 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CTSLP07711 333 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CYP11B1P15538 503 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PRLRP16471 622 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DGKAP23743 735 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 RRM1P23921 792 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 TAS2R38P59533 333 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 DAB2P98082 770 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ZNF284Q2VY69 593 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PROX2Q3B8N5 592 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 ARSIQ5FYB1 569 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.34□□□□□ -1.07
COCH-211ENST00000557065 HES3Q5TGS1 186 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms