RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ADPRH	P54922	357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GNA12	Q03113	381 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CDO1	Q16878	200 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	HLA-B	Q31612	363 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		Q6ZVU0	165 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GANC	Q8TET4	914 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MAGEH1	Q9H213	219 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GVT2	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM170A	A1A519	330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA12	O60330	932 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GJB6	O95452	261 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CD160	O95971	181 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PRNP	P04156	253 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RRM1	P23921	792 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CHRNA3	P32297	505 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PBX1	P40424	430 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CTSK	P43235	329 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CNTN1	Q12860	1018 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	KIF19	Q2TAC6	998 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TRIM69	Q86WT6	500 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SNX19	Q92543	992 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PR77	199 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SYCE3	A1L190	88 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		K7ERQ8	282 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CBX4	O00257	560 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CCP110	O43303	1012 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RTN2	O75298	545 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TRIM16	O95361	564 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CTSL	P07711	333 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	HTR7	P34969	479 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NUMB	P49757	651 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	METAP1	P53582	386 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ARF5	P84085	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OVGP1	Q12889	678 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	HDAC8	Q9BY41	377 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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