RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SH3GL3Q99963 347 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 VAV3Q9UKW4 847 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 H3BUI4 141 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PAOXQ6QHF9 649 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HMGB4Q8WW32 186 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 WBP1LQ9NX94 342 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GABRQQ9UN88 632 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTC26A0AVF1 554 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 E2F8A0AVK6 867 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TTLL8A6PVC2 850 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNA1P02708 482 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IFNA16P05015 189 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HBQ1P09105 142 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PSMC3P17980 439 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TACR2P21452 398 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LAPTM5Q13571 262 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FGL2Q14314 439 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC6Q86X45 466 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PHF21AQ96BD5 680 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 IER2Q9BTL4 223 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GTH6 734 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RASA4BC9J798 803 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDH3P22223 829 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GRIA2P42262 883 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TRPC1P48995 793 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HYIQ5T013 277 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RASIP1Q5U651 963 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CEP76Q8TAP6 659 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CDH16O75309 829 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GLRA3O75311 464 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ENDOD1O94919 500 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GUCA1CO95843 209 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 MGAT5Q09328 741 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM124AQ86V42 546 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KSR1Q8IVT5 923 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ELMO1Q92556 727 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 BORCS6Q96GS4 357 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF599Q96NL3 588 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SNX24Q9Y343 169 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RGPD5Q99666 1765 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 USP27XA6NNY8 438 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ENPP3O14638 875 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 APBB3O95704 486 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 GRK2P25098 689 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 HPCAL1P37235 193 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CXCL12P48061 93 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNK10P57789 538 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 INPP5AQ14642 412 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KYNUQ16719 465 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PARP6Q2NL67 630 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 UBXN7O94888 489 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-209ENST00000550857 KCNE1P15382 129 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms