RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MANEALQ5VSG8 457 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 LIPMQ5VYY2 423 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RAPH1Q70E73 1250 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IFNL1Q8IU54 200 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CALML6Q8TD86 181 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 EDEM1Q92611 657 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DPF3Q92784 378 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SORT1Q99523 831 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GLOD4Q9HC38 313 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MIOSQ9NXC5 875 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NDE1Q9NXR1 346 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TRIP11Q15643 1979 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CEP350Q5VT06 3117 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 H0Y3Z8 333 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DFFAO00273 331 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SEPT4O43236 478 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ITM2AO43736 263 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 USP12O75317 370 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DDHD2O94830 711 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PRKCGP05129 697 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CSRP3P50461 194 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CACNA2D1P54289 1103 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ARHGAP8P85298 464 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KDSRQ06136 332 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KLC1Q07866 573 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TUBB3Q13509 450 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 LAMB3Q13751 1172 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 BLMHQ13867 455 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CES4AQ5XG92 561 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IRGCQ6NXR0 463 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CES3Q6UWW8 571 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ACAD11Q709F0 780 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GALNT7Q86SF2 657 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 GPATCH11Q8N954 259 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 LPPQ93052 612 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CCDC126Q96EE4 140 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MFSD3Q96ES6 412 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ZNF333Q96JL9 665 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FAR2Q96K12 515 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C1orf74Q96LT6 269 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 RANBP9Q96S59 729 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 THTPAQ9BU02 230 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 DRC3Q9H069 523 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 VCXQ9H320 206 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 OXSMQ9NWU1 459 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 PADI3Q9ULW8 664 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 HEATR9A2RTY3 570 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-205ENST00000546891 MYADML2A6NDP7 307 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms