RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LPAR1	Q92633	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MYMK	A6NI61	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NPHP1	O15259	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DDAH2	O95865	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SCP2	P22307	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HNF1B	P35680	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GJC1	P36383	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MTNR1A	P48039	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125		B4DGG1	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125		H0YGN5	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MDM4	O15151	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IFNA2	P01563	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	IL1A	P01583	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	POLB	P06746	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TNFSF8	P32971	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CLCNKB	P51801	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PPAT	Q06203	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CHRND	Q07001	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CD180	Q99467	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MROH8	Q9H579	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	MST1R	Q04912	1400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0A0MQY5	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	KLKB1	P03952	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	CD72	P21854	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PGM1	P36871	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PTPN9	P43378	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125		Q5PR19	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	HSPH1	Q92598	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-231	ENST00000544125	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-231	ENST00000544125	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-231	ENST00000544125	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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