RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 GRK6P43250 576 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RXRGP48443 463 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CCT8P50990 548 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NXPH1P58417 271 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CDR2Q01850 454 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 BNIP3Q12983 259 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CAMK2BQ13554 666 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NCAPHQ15003 741 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC14Q49A88 953 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MANEALQ5VSG8 457 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LINGO4Q6UY18 593 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM131BQ86XD5 332 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF677Q86XU0 584 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 EMC1Q8N766 993 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CHST14Q8NCH0 376 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 OR7D4Q8NG98 312 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ARRDC3Q96B67 414 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SERAC1Q96JX3 654 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A13Q9UJS0 675 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ILVBLA1L0T0 632 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 C2CD4BA6NLJ0 364 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM72CH0Y354 149 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SRGAP2O75044 1071 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GJB6O95452 261 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RHOCP08134 193 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CHRNA3P32297 505 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ADRA1BP35368 520 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SOX5P35711 763 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 C21orf59P57076 290 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ARF5P84085 180 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 POM121L1PQ3SYA9 428 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM72AQ5TYM5 149 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM46CQ5VWP2 391 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM72DQ6L9T8 149 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NLRP14Q86W24 1093 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM69Q86WT6 500 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM72BQ86X60 149 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PROSER1Q86XN7 944 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DCAF4L2Q8NA75 395 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TMIEQ8NEW7 156 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 JOSD2Q8TAC2 188 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RXFP2Q8WXD0 754 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TSC1Q92574 1164 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC3BQ9H195 1237 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CAAP1Q9H8G2 361 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM51Q9NW97 253 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NEU3Q9UQ49 428 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CA5BQ9Y2D0 317 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CHD5Q8TDI0 1954 aa12.09□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CBX4O00257 560 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 OR1E1P30953 314 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ACVRL1P37023 503 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 COPB1P53618 953 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT83P78385 493 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP11AP98196 1134 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF284Q2VY69 593 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ARSIQ5FYB1 569 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC31Q6UY01 552 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 IQCHQ86VS3 1027 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa12.08□□□□□ -0.48
CLSTN3-211ENST00000541667 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms