RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 HCAR3P49019 387 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 ARF5P84085 180 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SPA17Q15506 151 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 DPYSL2Q16555 572 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 PARP15Q460N3 678 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 Q6ZVU0 165 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 GANCQ8TET4 914 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 FAM129BQ96TA1 746 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 CEP44Q9C0F1 390 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 RASA4O43374 803 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 KDELR3O43731 214 aa22.42■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 IL1BP01584 269 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 TCF4P15884 667 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SLC8A1P32418 973 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 MPLP40238 635 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 PSMD8P48556 350 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 USP30Q70CQ3 517 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 FAM124AQ86V42 546 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 RFFLQ8WZ73 363 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 FOXJ1Q92949 421 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 GPR174Q9BXC1 333 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 K7ERQ8 282 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 MCF2LO15068 1137 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 MID1O15344 667 aa22.41■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 PTGER3P43115 390 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.4■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 BUB1O43683 1085 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF806P0C7X5 589 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 GJC1P36383 396 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 DNA2P51530 1060 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 SERINC3Q13530 473 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRK-222ENST00000532751 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 LZTR1Q8N653 840 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 SPC24Q8NBT2 197 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 OR2A12Q8NGT7 310 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC19Q9H756 370 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-222ENST00000532751 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.39■■□□□ 1.17
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