RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523446.1

LINC01848-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1848, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC01848, Length 518 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01848-201ENST00000523446 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 AMFRQ9UKV5 643 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC01848-201ENST00000523446 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 KDELR3O43731 214 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SIN3BO75182 1162 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ALDH1A2O94788 518 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MAP3K6O95382 1288 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 GABRG2P18507 467 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 NDUFV2P19404 249 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CTNNA2P26232 953 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 DYNLT1P63172 113 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TCF15Q12870 199 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 AFMIDQ63HM1 303 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 KAZNQ674X7 775 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PQLC3Q8N755 202 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 FAF2Q96CS3 445 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 RNF157Q96PX1 679 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PRRX2Q99811 253 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SP110Q9HB58 689 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CD248Q9HCU0 757 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CCDC66A2RUB6 948 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 J3KR12 359 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 APOL1O14791 398 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ATP9BO43861 1147 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 KRT10P13645 584 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CDKN2BP42772 138 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 DLG2Q15700 870 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 STK40Q8N2I9 435 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 LZTR1Q8N653 840 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 KDM1BQ8NB78 822 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 FRS2Q8WU20 508 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ALG3Q92685 438 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 SUN2Q9UH99 717 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 AXIN1O15169 862 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TMCC1O94876 653 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CLCN6P51797 869 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 COPAP53621 1224 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 RWDD2BP57060 319 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 GBE1Q04446 702 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 RASSF3Q86WH2 238 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 OR2T3Q8NH03 318 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 EXD1Q8NHP7 514 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PTPRN2Q92932 1015 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 INVSQ9Y283 1065 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 HEY1Q9Y5J3 304 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 R4GN57 208 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZNF487B1APH4 448 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 ZSCAN12O43309 604 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PRAMEF11O60813 436 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 CD160O95971 181 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PSMD8P48556 350 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 PTPN5P54829 565 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC01848-201ENST00000523446 NRLP54845 237 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms