RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HSPB6	O14558	160 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TMCC1	O94876	653 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GLUD1	P00367	558 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GSTM2	P28161	218 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PCP4	P48539	62 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GLUD2	P49448	558 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PDCL	Q13371	301 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	DCTN1	Q14203	1278 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	RPS6KA2	Q15349	733 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SHB	Q15464	509 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	C5orf22	Q49AR2	442 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	3.16	□□□□□ -1.9	3e-6	■■■■□ 23.5
CDK1-208	ENST00000519760	CDT1	Q9H211	546 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	KL	Q9UEF7	1012 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CDK1-208	ENST00000519760	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	C17orf100	A8MU93	164 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CLDN7	O95471	211 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	PRSS2	P07478	247 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ITGA2B	P08514	1039 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ACP5	P13686	325 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CHN1	P15882	459 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	GNLY	P22749	145 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	PRKCH	P24723	683 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SERPINA4	P29622	427 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SERPINF1	P36955	418 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ4	P48050	445 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CDK7	P50613	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ART1	P52961	327 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	AP2B1	P63010	937 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	BNC1	Q01954	994 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	BTK	Q06187	659 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	KIF5A	Q12840	1032 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ZACN	Q401N2	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ATG9B	Q674R7	924 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CUZD1	Q86UP6	607 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	FJX1	Q86VR8	437 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	FAR1	Q8WVX9	515 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	C3orf49	Q96BT1	292 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	PIGS	Q96S52	555 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	LRFN1	Q9P244	771 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	MST1R	Q04912	1400 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1B0GUV1	79 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SYT5	O00445	386 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SYN3	O14994	580 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	DDAH2	O95865	285 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	HLA-DQA2	P01906	255 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ARSA	P15289	507 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	OAZ1	P54368	228 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CDH12	P55289	794 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	ERVFC1-1	P60608	527 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	COASY	Q13057	564 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	GXYLT1	Q4G148	440 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SYT13	Q7L8C5	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	BICD2	Q8TD16	824 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	GPT2	Q8TD30	523 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CDK1-208	ENST00000519760	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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