RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDT1P36639 197 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETFBP38117 255 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF165P49910 485 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDAC4P56524 1084 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNA12Q03113 381 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB6CQ53S08 254 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MANEALQ5VSG8 457 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2A12Q8NGT7 310 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NTAN1Q96AB6 310 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB6CQ9H0N0 254 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP295Q9C0D2 2601 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQC6 194 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD62A6NC57 917 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7ERQ8 282 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CBX4O00257 560 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMPSTE24O75844 475 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJB6O95452 261 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNA3P32297 505 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSKP43235 329 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPKAPK2P49137 400 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C21orf59P57076 290 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM193AP78312 1265 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCAPQ12770 1279 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLRX5Q86SX6 157 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR7D4Q8NG98 312 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAP1Q92560 729 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPON2Q9BUD6 331 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP44Q9C0F1 390 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP13A1Q9HD20 1204 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM248Q9NWD8 314 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.21■□□□□ 0.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLRT2O43155 660 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BNIP3LO60238 219 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHGA12O60330 932 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTN2O75298 545 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRNPP04156 253 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFAIP3P21580 790 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRM1P23921 792 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD38P28907 300 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METAP1P53582 386 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTN1Q12860 1018 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC45A4Q5BKX6 768 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGBL4Q5VU57 503 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEK5Q6P3R8 708 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC24Q6P3W2 148 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINGO4Q6UY18 593 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP14Q86W24 1093 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM69Q86WT6 500 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MCOLN2Q8IZK6 566 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC6A18Q96N87 628 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYT11Q9BT88 431 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEH1Q9H213 219 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PREBQ9HCU5 417 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMTF1Q9Y222 760 aa17.2■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GTH6 734 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PR77 199 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM72CH0Y354 149 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRIG2O94898 1065 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTSLP07711 333 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLDCP23378 1020 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L1CAMP32004 1257 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AIF1P55008 147 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IQCB1Q15051 598 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM72AQ5TYM5 149 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM72DQ6L9T8 149 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM72BQ86X60 149 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLPP6Q8IY26 295 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DRC7Q8IY82 874 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC185Q8N715 623 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms