RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GPR27Q9NS67 375 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 IRAK2O43187 625 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PDGFRAP16234 1089 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NNMTP40261 264 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FGL2Q14314 439 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PDILTQ8N807 584 aa15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TPP1O14773 563 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 IGLV3-27P01718 113 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CTSLP07711 333 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NOS2P35228 1153 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TBX4P57082 545 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZACNQ401N2 412 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 MS4A13Q5J8X5 152 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SV2AQ7L0J3 742 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 KYQ8NBH2 561 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GLMNQ92990 594 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PRR19A6NJB7 356 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3R2O00459 728 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LIFP15018 202 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CCKBRP32239 447 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 AP3M2P53677 418 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 OXCT1P55809 520 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CLDN10P78369 228 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 UNC45BQ8IWX7 931 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LGI2Q8N0V4 545 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TAF4BQ92750 862 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC61Q9BV99 259 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CLPBQ9H078 707 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SPASTQ9UBP0 616 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CLIC4Q9Y696 253 aa15.95■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1W2PQ27 194 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1W2PQ64 194 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1W2PQC6 194 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SPTLC2O15270 562 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 YY2O15391 372 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 BMP15O95972 392 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ANXA6P08133 673 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PRKAR1AP10644 381 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TXLNAP40222 546 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DLG2Q15700 870 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PMEPA1Q969W9 287 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM74Q96NL1 305 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.94■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 K7EM74 188 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 MCF2LO15068 1137 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NKX2-8O15522 239 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 DUX1O43812 170 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PRKCGP05129 697 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LCP1P13796 627 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 TSHRP16473 764 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NEK5Q6P3R8 708 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 NKD1Q969G9 470 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 CYP3A43Q9HB55 503 aa15.93■□□□□ 0.14
ALYREF-204ENST00000512673 LMO7DNF2Z398 122 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms