RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC57Q8N9N7 239 aa27.39■■□□□ 1.98
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 HMCESQ96FZ2 354 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-212ENST00000508338 KLC2Q9H0B6 622 aa27.39■■□□□ 1.98
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SH3BP2-212ENST00000508338 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.38■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 ALOX15BO15296 676 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 CD48P09326 243 aa27.38■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf64Q5T6V5 341 aa27.38■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC39A8Q9C0K1 460 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL11Q9NVR0 708 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 AMFRQ9UKV5 643 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 HYOU1Q9Y4L1 999 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 LILRB5O75023 590 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 EXD1Q8NHP7 514 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRN2Q92932 1015 aa27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 SPACA7Q96KW9 195 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 RNF157Q96PX1 679 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 SIN3BO75182 1162 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 PALMO75781 387 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 C22orf39Q6P5X5 142 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 UBL4BQ8N7F7 174 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF366Q8N895 744 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH19Q8TAB3 1148 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 ALS2CR12Q96Q35 445 aa27.36■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 IL10RBQ08334 325 aa27.35■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 FAM46CQ5VWP2 391 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-212ENST00000508338 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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SH3BP2-212ENST00000508338 RPP40O75818 363 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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