RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 NRCAMQ92823 1304 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 GLP2RO95838 553 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 RENBPP51606 427 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 POU4F1Q01851 419 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SGO1Q5FBB7 561 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TBCELQ5QJ74 424 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 LIPMQ5VYY2 423 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 MFN1Q8IWA4 741 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 DENND1AQ8TEH3 1009 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TINF2Q9BSI4 451 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 RGS18Q9NS28 235 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 FAM8A1Q9UBU6 413 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 CDH22Q9UJ99 828 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ATP6AP2O75787 350 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SOAT2O75908 522 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 C22orf31O95567 290 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC166P0CW27 439 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PSEN2P49810 448 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 SCNN1GP51170 649 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ARHGDIAP52565 204 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF132P52740 706 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 PPIL2Q13356 520 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 NFYCQ13952 458 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TEPSINQ96N21 525 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 XYLT2Q9H1B5 865 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 CAPN8A6NHC0 703 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM114B3SHH9 223 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 GPR182O15218 404 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 BUD23O43709 281 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF23P17027 643 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 L1CAMP32004 1257 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 OCA2Q04671 838 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 DLG2Q15700 870 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 INSCQ1MX18 579 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 DHFR2Q86XF0 187 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ASIC4Q96FT7 647 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS3-201ENST00000503362 ABLIM1O14639 778 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LYNP07948 512 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJB2P25686 324 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLC18A2Q05940 514 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FBXW8Q8N3Y1 598 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LZTR1Q8N653 840 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RIC8BQ9NVN3 520 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 STX7O15400 261 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CABYRO75952 493 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 NDUFV1P49821 464 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FOLH1Q04609 750 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FBXO32Q969P5 355 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 BCO2Q9BYV7 579 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ALG9Q9H6U8 611 aa13.46□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RAB10P61026 200 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 LBRQ14739 615 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PPTC7Q8NI37 304 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PCYT2Q99447 389 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 MUC3BQ9H195 1237 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RHBDL2Q9NX52 303 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLC12A8A0AV02 714 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TEX44Q53QW1 395 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ZFP42Q96MM3 310 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 AGAP2Q99490 1192 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A23Q9BV35 468 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 APOL5Q9BWW9 433 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ITM2AO43736 263 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 ALBP02768 609 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RABGGTBP53611 331 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PSME3P61289 254 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 RAD51Q06609 339 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 DPYSL2Q16555 572 aa13.45□□□□□ -0.26
SPCS3-201ENST00000503362 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms