RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF185O15231 689 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 NCAM2O15394 837 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 MAFKO60675 156 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 TUBB4AP04350 444 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 COL9A1P20849 921 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 ST8SIA6P61647 398 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SLC20A2Q08357 652 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 C2orf27AQ580R0 203 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 TTC13Q8NBP0 860 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 MYO19Q96H55 970 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 MS4A14Q96JA4 679 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 TSGA13Q96PP4 275 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 ACOX2Q99424 681 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.59■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 NPC1O15118 1278 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 CD160O95971 181 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 MT-CO1P00395 513 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 Q6ZS52 159 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 KDM1BQ8NB78 822 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 CCNYQ8ND76 341 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 CLDN23Q96B33 292 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.58■■□□□ 1.05
TTYH3-207ENST00000498454 SRCP12931 536 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CCNCP24863 283 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 NNMTP40261 264 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 IL12RB1P42701 662 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 WASP42768 502 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CHPFQ8IZ52 775 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ALLCQ8N6M5 410 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 LGMNQ99538 433 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.57■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 HACD1B0YJ81 288 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 H7C0C1 242 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 K7ERQ8 282 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 MCF2LO15068 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ATP9BO43861 1147 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PEX11BO96011 259 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 NTSR1P30989 418 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ATP5OP48047 213 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CLCN6P51797 869 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 XRCC4Q13426 336 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ENPP2Q13822 863 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF599Q96NL3 588 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CHRDQ9H2X0 955 aa21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 TTC34A8MYJ7 566 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 WASH3PC4AMC7 463 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 MATN3O15232 486 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 TMCC1O94876 653 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 RBP3P10745 1247 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 HLA-EP13747 358 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 PRKCHP24723 683 aa21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF33AQ06730 810 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms