RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KIAA1191	Q96A73	305 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	GAREM1	Q9H706	876 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.87	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RASA4B	C9J798	803 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ASAP2	O43150	1006 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RASA4	O43374	803 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ13	O60928	360 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CGA	P01215	116 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	LYL1	P12980	280 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RCAN1	P53805	252 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TRAF2	Q12933	501 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SPATA20	Q8TB22	786 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	WBP1	Q96G27	269 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	NPAS1	Q99742	590 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		3.86	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PRR23A	A6NEV1	266 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	AQP12B	A6NM10	295 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ASNA1	O43681	348 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	BUB3	O43684	328 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	KRT36	O76013	467 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TMCC1	O94876	653 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CLDN7	O95471	211 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SP1	P08047	785 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	FCGR2A	P12318	317 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	GYS1	P13807	737 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TM4SF4	P48230	202 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CDH12	P55289	794 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	3.85	□□□□□ -1.79	2e-7	■■■■■ 32.9
USP34-222	ENST00000498268	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HMGB4	Q8WW32	186 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IGSF21	Q96ID5	467 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MST1R	Q04912	1400 aa		3.85	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	GRM8	O00222	908 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	BMPR1B	O00238	502 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CYP21A2	P08686	494 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TRIM27	P14373	513 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CDK18	Q07002	472 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	HLF	Q16534	295 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	LONRF1	Q17RB8	773 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	TRIM60	Q495X7	471 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	C5orf22	Q49AR2	442 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	MON1B	Q7L1V2	547 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	PJA1	Q8NG27	643 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	STYX	Q8WUJ0	223 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	ZNF333	Q96JL9	665 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	CERS4	Q9HA82	394 aa		3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	ITM2A	O43736	263 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	TNFRSF6B	O95407	300 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	LARGE1	O95461	756 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	PRKCH	P24723	683 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	GPT2	Q8TD30	523 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ9	Q92806	393 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	MUL1	Q969V5	352 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.83	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	ABCB4	P21439	1286 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	MXI1	P50539	228 aa		3.82	□□□□□ -1.8
USP34-222	ENST00000498268	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.82	□□□□□ -1.8

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