RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 MYCT1Q8N699 235 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 GPR156Q8NFN8 814 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 TET1Q8NFU7 2136 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 PPM1EQ8WY54 764 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 USP28Q96RU2 1077 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 ARID2Q68CP9 1835 aa4.86□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 BECN2A8MW95 431 aa4.85□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 K7ESF4 209 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 MGEA5O60502 916 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 PPM1AP35813 382 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.85□□□□□ -1.63
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RBM39-240ENST00000495293 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.634e-19■□□□□ 9.8
RBM39-240ENST00000495293 ECHS1P30084 290 aa4.84□□□□□ -1.63
RBM39-240ENST00000495293 CRHR1P34998 444 aa4.84□□□□□ -1.63
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