RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 MTRRQ9UBK8 725 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TET1Q8NFU7 2136 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TMEM221A6NGB7 291 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM72CH0Y354 149 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 M0R296 226 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PFDN1O60925 122 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.18□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.18□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 MZB1Q8WU39 189 aa7.18□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ASB3Q9Y575 518 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SNX10Q9Y5X0 201 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 EML5Q05BV3 1969 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 THP07101 528 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 F7P08709 466 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FAM200BP0CF97 657 aa7.17□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 CSH2P0DML3 217 aa7.17□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 XRCC4Q13426 336 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 FAM122AQ96E09 287 aa7.17□□□□□ -1.26
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HERC4-211ENST00000492996 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 TMEM237Q96Q45 408 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 SMOQ99835 787 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 PPCSQ9HAB8 311 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 DDIT4Q9NX09 232 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 GDE1Q9NZC3 331 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 ZFATQ9P243 1243 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 FZD10Q9ULW2 581 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 CHKBQ9Y259 395 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 A8MUI8 341 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 COPEO14579 308 aa7.17□□□□□ -1.26
HERC4-211ENST00000492996 B3GAT3O94766 335 aa7.17□□□□□ -1.26
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