RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 CACNG3O60359 315 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 UQCRHP07919 91 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 DGKGP49619 791 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB17Q13105 803 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 C4orf22Q6V702 233 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 SNAP91O60641 907 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 OPHN1O60890 802 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TFF2Q03403 129 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 CALCOCO2Q13137 446 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 AAK1Q2M2I8 961 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ALG14Q96F25 216 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 SNF8Q96H20 258 aa22.48■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.48■■□□□ 1.19
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PSPC1-204ENST00000492741 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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PSPC1-204ENST00000492741 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 BBS5Q8N3I7 341 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 MAML1Q92585 1016 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 FATE1Q969F0 183 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 NXPE3Q969Y0 559 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF599Q96NL3 588 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PNKPQ96T60 521 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 KCNK12Q9HB15 430 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 DEC1Q9P2X7 70 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 VPS51Q9UID3 782 aa22.47■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 F5H423 210 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TULP3O75386 442 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 MCM3P25205 808 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 MMP13P45452 471 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PLK1P53350 603 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ITKQ08881 620 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TRADDQ15628 312 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 RETSATQ6NUM9 610 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 LINGO4Q6UY18 593 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 C12orf40Q86WS4 652 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
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PSPC1-204ENST00000492741 ACDQ96AP0 544 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TEKT5Q96M29 485 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 IL12RB2Q99665 862 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 GDF3Q9NR23 364 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO10Q9UK96 956 aa22.46■■□□□ 1.19
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PSPC1-204ENST00000492741 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.46■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM24O15164 1050 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PEX11BO96011 259 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 DMC1Q14565 340 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF235Q14590 738 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 FUT11Q495W5 492 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 AHI1Q8N157 1196 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 BBOF1Q8ND07 529 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 RUBCNQ92622 972 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 LMLNQ96KR4 655 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PDFQ9HBH1 243 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 NT5MQ9NPB1 228 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.45■■□□□ 1.19
PSPC1-204ENST00000492741 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.45■■□□□ 1.19
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PSPC1-204ENST00000492741 GJA4P35212 333 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 SLC6A11P48066 632 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ARF5P84085 180 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 FAXCQ5TGI0 409 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 E7EVH7 732 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 ZMPSTE24O75844 475 aa22.44■■□□□ 1.18
PSPC1-204ENST00000492741 TUBBP07437 444 aa22.44■■□□□ 1.18
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